CEUS Revista Estudiantil
Revision sistémica

Resistencia antimicrobiana en enterobacterias por aguas residuales en Latinoamérica: una revisión sistemática

Antimicrobial resistance in enterobacteria from wastewater in Latin America: a systematic review

Recepción: 12 de mayo de 2026Aprobación: 1 de julio de 2026Publicación: 20 de agosto de 2026
Paulina Antonella Ochoa Roblesantoor2721@gmail.comEstudiante de Medicina, Universidad del Azuay, EcuadorORCID: 0009-0009-8141-3889
María Antonia Corral Bermeoantoniacorralb8827@gmail.comEstudiante de Medicina, Universidad del Azuay, EcuadorORCID: 0009-0006-1779-0709
Carlota Valentina Torres Macíastcarlota2006@gmail.comEstudiante de Medicina, Universidad del Azuay, EcuadorORCID: 0009-0006-1398-9606
Mariana Isabel Freire Cárdenasmarianafreirec@gmail.comEstudiante de Medicina, Universidad del Azuay, EcuadorORCID: 0009-0008-3876-5961
Christopher Mateo Minchala Castromateominch@gmail.comEstudiante de Medicina, Universidad del Azuay, EcuadorORCID: 0009-0002-1650-1283

DOI: https://doi.org/10.26871/ceus.v8i1.297

Resumen

Objetivo: Analizar la asociación entre la descarga de aguas residuales y la presencia de resistencia antimicrobiana en enterobacterias en cuerpos de agua superficiales de América Latina.

Métodos: Se realizó una revisión sistemática de estudios observacionales y microbiológicos (2020–2026) en PubMed, Scopus, Web of Science y LILACS; se incluyeron estudios en América Latina que evaluaran resistencia antimicrobiana en enterobacterias asociadas a aguas residuales.

Resultados: La síntesis narrativa identificó a E. coli como microorganismo destacado en todos los diferentes cuerpos de agua, con perfiles MDR del 91–100 %. Los genes blaCTX-M, blaKPC, blaNDM y mcr-1 fueron encontrados en efluentes hospitalarios, PTAR y aguas de riego agrícola,

confirmando rutas de diseminación hacia la cadena alimentaria. Los métodos de tratamiento convencional demostraron ser insuficientes para eliminar ARGs de mayor importancia clínica crítica.

Conclusiones: Las aguas residuales de América Latina representan una vía activa de transmisión para la resistencia antimicrobiana, con ARGs críticos presentes incluso en medios de consumo humano. Se necesita incorporar vigilancia ambiental de ARGs en los sistemas epidemiológicos nacionales, actualizar marcos regulatorios e invertir en saneamiento avanzado bajo el enfoque One Health.

Registro del artículo: Revisión sistemática disponible en la base de datos de PROSPERO (CRD420261360509). Disponible en: https://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO/view/ CRD420261360509

Palabras clave: Aguas residuales; beta-Lactamasas enterobacteriaceae; resistencia a los antimicrobianos; revisión sistemática.

Abstract

Objective: To analyze the association between wastewater discharge and the presence of antimicrobial resistance in enterobacteria in surface water bodies in Latin America.

Methods: A systematic review of observational and microbiological studies was conducted using PubMed, Scopus, Web of Science, and LILACS. Studies conducted in Latin America that evaluated antimicrobial resistance in enterobacteria associated with wastewater discharge were included (2020-2026).

Results: The narrative synthesis identified E. coli as a prominent microorganism across all water bodies studied, exhibiting multidrug-resistant (MDR) profiles ranging from 91% to 100%. The blaCTX-M, blaKPC, blaNDM, and mcr-1 genes were detected in hospital effluents, wastewater treatment plants (WWTPs), and agricultural irrigation waters, confirming dissemination pathways into the food chain. Conventional treatment methods were found to be insufficient for the removal of antimicrobial resistance genes (ARGs) of critical clinical importance.

Conclusions: Wastewater in Latin America represents an active transmission pathway for antimicrobial resistance, with critical antimicrobial resistance genes (ARGs) detected even in environments associated with human consumption. There is an urgent need to integrate environmental surveillance of ARGs into national epidemiological monitoring systems, update regulatory frameworks, and invest in advanced sanitation technologies under the One Health approach.

Registration: This systematic review was registered in the PROSPERO database (CRD420261360509). Available at: https://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO/view/ CRD420261360509

Keywords: Antimicrobial resistance; beta-lactamases; Enterobacteriaceae; systematic review; wastewater.

Introducción

La resistencia antimicrobiana constituye una crisis ecológica y sanitaria de alcance global, reconocida por la Organización Mundial de la Salud como una de las principales amenazas para la salud pública del siglo XXI. Más allá del ámbito clínico, este fenómeno ha adquirido un alcance ambiental crítico, donde los sistemas hídricos actúan como reservorios y vías de dispersión de bacterias resistentes y genes de resistencia antimicrobiana. En este ámbito, la interacción entre actividad humana, uso indiscriminado de antibióticos y deficiencias en el tratamiento de aguas residuales establece un escenario beneficioso para el incremento del problema.

Los efluentes hospitalarios, urbanos e industriales representan canales clave en la diseminación de bacterias multirresistentes hacia ríos, lagos y océanos. Esto se debe mayormente a que las plantas convencionales de tratamiento de aguas residuales no están diseñadas para eliminar por completo microorganismos resistentes ni material genético como los genes de resistencia antimicrobiana. La evidencia científica demuestra que estas infraestructuras pueden actuar como verdaderos “reactores biológicos”, facilitando la selección y concentración de patógenos críticos como Escherichia coli productora de betalactamasas de espectro expandido, asociados a infecciones de difícil tratamiento.

El impacto de este fenómeno supera lo microbiológico para convertirse en un problema sistémico con implicaciones ecológicas, clínicas y sociales. Los cuerpos de agua contaminados funcionan como reservorios del llamado resistoma ambiental, desde donde los genes de resistencia pueden volver a incorporarse en poblaciones humanas y animales a través del consumo de agua, la irrigación de cultivos, la pesca o el contacto recreativo. La detección de genes de resistencia a antibióticos de último recurso, como los carbapenémicos, en sedimentos y aguas superficiales de diferentes regiones del mundo demuestra que la resistencia antimicrobiana ha dejado de ser un problema limitado al entorno hospitalario.

Desde una visión integral, este entorno requiere ser abordado bajo el enfoque de One Health, que reconoce la interdependencia entre la salud humana, animal y ambiental. Por esta razón, se vuelve indispensable fortalecer la vigilancia epidemiológica ambiental, modernizar los sistemas de tratamiento de aguas mediante tecnologías avanzadas y establecer regulaciones más estrictas sobre la liberación de contaminantes farmacológicos en los ecosistemas.

En este contexto, la realización de una revisión sistemática es clave para sintetizar la evidencia disponible sobre la resistencia antimicrobiana en enterobacterias asociada a la exposición a aguas residuales en América Latina, haciendo posible comprender la dimensión del problema y orientar medidas de minimización con impacto en la salud pública, el medio ambiente y la sostenibilidad económica.

Pregunta a desarrollar

PICO:

  • P (Población): cuerpos de agua superficiales en América Latina (ríos, lagos, aguas receptoras)
  • I (Intervención/exposición): descarga de aguas residuales urbanas u hospitalarias
  • C (Comparación): cuerpos de agua sin influencia directa de descargas de aguas residuales
  • O (Outcome): prevalencia de enterobacterias productoras de ESBL y/o portadoras de genes de resistencia antimicrobiana

Pregunta PICO:

En cuerpos de agua superficiales en América Latina, ¿la descarga de aguas residuales urbanas u hospitalarias, en comparación con cuerpos de agua sin influencia de estas descargas, se asocia con una mayor prevalencia de enterobacterias productoras de beta-lactamasas de espectro extendido (ESBL) y/o portadoras de genes de resistencia antimicrobiana?

Metodología

Registro de la revisión sistemática

Esta revisión sistemática fue registrada en la base de datos PROSPERO bajo el número de registro CRD420261360509, disponible en: https://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO/view/ CRD420261360509. El registro se realizó previo al inicio de la extracción y síntesis de datos.

Estrategia de búsqueda

Se realizó una búsqueda sistemática de la literatura científica basada en los componentes de la pregunta PICO, con el objetivo de identificar estudios relacionados con la resistencia antimicrobiana en enterobacterias asociada a la exposición a aguas residuales en América Latina.

La búsqueda se llevó a cabo en las bases de datos PubMed, SciELO, LILACS y HINARI, seleccionadas por su cobertura en ciencias de la salud y literatura regional. Para la construcción de la estrategia se emplearon descriptores controlados del DeCS (Descriptores en Ciencias de la Salud) y del MeSH (Medical Subject Headings), complementados con términos libres, con el fin de maximizar la sensibilidad de la búsqueda. La búsqueda se limitó a artículos publicados entre 2020 y 2026, en idioma inglés, español y portugués, con el propósito de garantizar la accesibilidad y relevancia de la evidencia recopilada.

Los términos de búsqueda principales fueron los siguientes: (“Antimicrobial Resistance”) AND (“Wastewater” OR “Sewage”) AND (“Enterobacteriaceae”) AND (“Latin America” OR “South America”)

La búsqueda se ajustó según el tesauro de cada base de datos consultada, utilizando tanto MeSH como el DeCS para establecer relaciones entre los conceptos clave de población, exposición y resultado.

Síntesis de resultados:

Debido a las diferencias entre los estudios incluidos en términos de diseño, tipo de matriz hídrica, técnicas microbiológicas y definición de resistencia, se realizó una síntesis descriptiva de los hallazgos. Estos se agruparon considerando el tipo de microorganismo identificado, patrones de resistencia, la fuente hídrica evaluada, mecanismos de diseminación y factores contextuales asociados.

Criterios de elegibilidad:

Criterios de inclusión

Se incluyeron estudios originales con datos primarios, de diseño observacional, tales como estudios transversales, de cohorte y de casos y controles, así como investigaciones microbiológicas realizadas en América Latina (2020–2026) que evaluaran resistencia antimicrobiana en enterobacterias aisladas de aguas residuales o cuerpos de agua influenciados por perfiles de

susceptibilidad, detección fenotípica de resistencia o identificación de genes asociados, incluyendo ESBL y carbapenemasas.. No se aplicaron restricciones de idioma.

Criterios de exclusión

Se excluyeron estudios sin datos primarios, revisiones, editoriales y cartas, así como investigaciones clínicas o en animales sin vínculo con el ambiente acuático, estudios fuera de América Latina, sin evaluación de resistencia antimicrobiana o sin acceso a texto completo. También se eliminaron registros duplicados o con información insuficiente.

Selección de estudios

Los registros identificados a partir de las bases de datos fueron importados a la plataforma Rayyan para su gestión, organización y eliminación de duplicados. Posteriormente, dos revisores realizaron de manera independiente el cribado inicial mediante la evaluación de títulos y resúmenes, aplicando los criterios de elegibilidad previamente establecidos. Teniendo en consideración la finalidad de reducir el sesgo de selección, las decisiones se llevaron a cabo de manera independiente y ciega dentro de las plataformas. Existieron discrepancias entre los revisores, sin embargo, fue resuelto mediante discusión y consenso. Los estudios considerados potencialmente relevantes fueron recuperados en texto completo y evaluados detalladamente con la finalidad de determinar su inclusión. El proceso se llevó a cabo con las recomendaciones de la guía PRISMA, garantizando transparencia, reproducibilidad y rigor metodológico.

Evaluación de calidad metodológica

La calidad metodológica de los estudios incluidos fue evaluada mediante la Escala Newcastle- Ottawa (NOS), la cual evalúa los siguientes dominios: criterios relacionados con la representatividad y el tamaño de la muestra, la claridad en la medición de la exposición a aguas contaminadas, la precisión de identificación microbiológica de enterobacterias y la metodología empleada para la determinación de resistencia antimicrobiana, a nivel fenotípico y genotípico.

La evaluación fue realizada de manera independiente por los revisores, con la finalidad de asegurar la validez y la fiabilidad de los resultados. De la misma manera, se valoró la concordancia entre el diseño de estudio y la adaptación de los métodos de análisis. Con estos elementos, todos los estudios fueron clasificados según su riesgo de sesgo en: bajo (7-9 estrellas), moderado (4-6 estrellas) o alto (0-3 estrellas), permitiendo una interpretación profunda y crítica de la evidencia incluida.

Figura 1. Evaluación de la calidad de información

Resultados

Tabla 1: Artículos incluidos

Titulo del documentoAutor(es)PaísDiseño del estudioFecha del estudio
Prevalence and Differential Plasmid Versus Chromosomal Distribution of Ribosome-Targeting Antibiotic Resistance Genes in Escherichia coli Isolates from River and Untreated Wastewater EnvironmentsMedina-Sánchez, J.R. ; Salvatierra, M.PanamáEstudio observacional transversal analítico con análisis microbiológico y genómico2026
Ampicillin-and Multidrug-Resistant Escherichia coli and Enterococcus spp. in Costa Rican Wastewater and Surface WaterBrodrick, E.A. ; González-Fernández, A.Costa RicaEstudio observacional, transversal y analítico-descriptivo2025
Environmental health of water bodies from a Brazilian Amazon Metropolis based on a conventional and metagenomic approachSiqueira, J.A.M. ; Teixeira, D.M.BrazilEstudio observacional, transversal, descriptivo-analíti co con enfoque metagenómico ambiental2024
Multidrug-resistant Enterobacteriaceae that produce antimicrobial resistance genes isolated from hospital effluents in PeruEstheysi, E.-G. ; Wong, O.I.PeruEstudio observacional, transversal, descriptivo-analíti co con enfoque microbiológico y molecular2025
Urban wastewater overflows as hotspots for dissemination of bacteria producing extended-spectrum β-lactamases and carbapenemases in the Suquía River, Argentina.Ruiz SE ; Morandini FNArgentinaEstudio observacional experimental de campo con análisis microbiológico y molecular2025
Hospital Wastewater as a Reservoir of Contaminants of Emerging Concern: A Study Report from South America, ChileAguilar-Rangel, E.J. ; Paredes-Cárcamo, F.ChileEstudio observacional transversal descriptivo2025
Hospital effluents as a reservoir of beta-lactamase-and carbapenemase-producing enterobacteriaceaeSoriano-Moreno, D.R. ; Yareta, J.PerúEstudio transversal descriptivo2021
Antimicrobial sensitivity profile of isolated Escherichia coli strains from surface water samples of the Carioca River-RJ, Brazilda Silva, T.S.M. ; Abrantes, J.A.BrazilEstudio observacional transversal descriptivo2022
Genomic characterization of a WHO critical priority isolate Enterobacter kobei ST2070 harboring OXA-10, KPC-2, and CTX-M-12 recovered from a water irrigation channel in Ecuador.Corrales-Martínez J ; Jaramillo KEcuadorEstudio observacional transversal descriptivo con análisis genómico (WGS)2024
Extended-Spectrum Beta-Lactamase-Producing Escherichia coli Isolated From Irrigation Waters and Produce in Ecuador.Montero L ; Irazabal JEcuadorEstudio observacional transversal analítico2021
Occurrence of Klebsiella pneumoniae ST244 and ST11 extensively drug-resistant producing KPC, NDM, OXA-370 in wastewater, Brazil.Montenegro K ; Flores CBrazilDescriptive crosssectional study2023
Multidrug resistance and diversity of resistance profiles in carbapenem-resistant Gram-negative bacilli throughout a wastewater treatment plant in ColombiaRodríguez, E.A. ; Garzón, L.M.ColombiaCross-sectional descriptive observational study2020
Metallo-beta-lactamase-producing Escherichia coli in the sewage of Mexico City: where do they come from?Lüneberg K ; Amábile-Cuevas CFMexicoEnvironmental observational study2022
Antimicrobial Resistance Patterns and Clonal Distribution of E. coli, Enterobacter spp. and Acinetobacter spp. Strains Isolated from Two Hospital Wastewater PlantsGalarde-López, Miguel ; Velazquez-Meza, Maria ElenaMexicoCross -sectional2022
Urban wastewater overflows as hotspots for dissemination of bacteria producing extended-spectrum β-lactamases and carbapenemases in the Suquía River, ArgentinaRuiz, Susana Eugenia ; Morandini, Fabrizzio NicolasArgentinaEnvironmental observational study2025
Plasmid and integron-associated antibiotic resistance in Escherichia coli isolated from domestic wastewater treatment plantsMendoza-Guido, Bradd ; Rivera-Montero, LuisCosta RicaObservational study with whole-genome sequencing (WGS)2025
Emerging contaminants and antibiotic resistance in the different environmental matrices of Latin AmericaReichert, Gabriela, Hilgert, Stephan, Fuchs, Stephan, Azevedo, Júlio César RodriguesAmérica Latina (Brasil, México, Argentina, Chile, Colombia)Estudio observacional transversal descriptivo2019
The occurrence of antimicrobial residues and antimicrobial resistance genes in urban drinking water and sewage in Southern BrazilRamalho, Rafaela, Mezzomo, Lisiane Cervieri, Machado, William, da Silva Morais Hein, Camila, Müller, Camila Zanfelice, da Silva, Thaisla Cristiane Borella, Jank, Louise, Lamas, Alex Elias, da Costa Ballestrin, Rogério Antônio, Wink, Priscila Lamb, Lima, Anderson Araújo de, Corção, Gertrudes, Martins, Andreza FranciscoBrasilEstudio observacional transversal analitico2022
Determination of Phylogroups, Pathotypes and Antibiotic Resistance Profiles of E. coli Isolates from Freshwater and Wastewater in the City of PanamaRodríguez Guevara, Gabriela A., Michelangelli, Emmanuel, Medina-Sánchez, Juan R., Mejía-Meléndez, Fermín, Espino, Carmen Indira, Moreno P., José E., Martínez Torres, Alex O., Querol-Audí, JordiPanamáEstudio observacional transversal analítico2025
Evaluating Antibiotic Resistance in Urban Rivers and Coral Reefs of Belize: Evidence for Hotspots and a Potential Screening ToolGaldamez, Ileana A., Jimenez, Karina, Cira, Marisol, Osborn, Katie, Ayad, Mariam, Lee, Christine M., Patel, Kai, Galdamez, Bryan A., Sloan, Ashlyn, Shenkiryk, Alexis, Cason, Taylor, Gomez, Nicole Auil, Phillips, Myles, Rosado, Samir, Rosado, Andria, Mishra, Deepak R., Cherrington, Emil A., Griffin, Robert, Jay, Jennifer A.BeliceEstudio observacional transversal descriptivo2026
Hospital sewage in Brazil: a reservoir of multidrug-resistant carbapenemase-producing EnterobacteriaceaeGonçalves, D.L.D.R., Chang, M.R., Nobrega, G.D., Venancio, F.A., Higa Júnior, M.G., Fava, W.S.BrasilEstudio observacional transversal analítico2024
Genomic surveillance of multidrug-resistant Escherichia coli and Klebsiella in clinical and wastewater isolates from a paediatric hospital in Lima, PeruAyzanoa, B., Castillo-Vilcahuaman, C., Salvatierra, G., Dávila-Barclay, A., Cuicapuza, D., Huancachoque, J., Calderón, M., Rizo-Patrón, E., Santillán-Salas, C., Gilman, R.H., Tsukayama, P.PerúEstudio observacional transversal analítico comparativo2026
Resistencia bacteriana a antibióticos en ambientes acuáticos: origen e implicaciones para la salud públicaRodríguez E, Jiménez JNColombiaRevisión narrativa de tema (bibliográfica)2023
Aminoglycoside resistance in domestic sewage and clinical Escherichia coli isolatesDe Oliveira Gomes B, Lima WG, Vargas Farias D, De Paiva MCBrasilEstudio observacional transversal comparativo2022
High clonal diversity of multidrug-resistant and extended spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli in a wastewater treatment plantAristizábal-Hoyos AM, Rodríguez EA, Arias L, Jiménez JNColombiaEstudio observacional longitudinal (6 muestreos)2019
Concern levels of beta-lactamase-producing Gram-negative bacilli in hospital wastewater: hotspot of antimicrobial resistance in Latin-AmericaAristizabal-Hoyos AM, Rodríguez EA, Torres-Palma RA, Jiménez JNColombiaNota técnica observacional descriptiva (2 muestreos por sitio)2022
Lack of wastewater treatment in a small town drives the spread of ESBL-producing Escherichia coli in irrigation watersVanderYacht T, Salinas L, Remerleitch T, Walas N, Ho T, Trueba G, Graham JPEcuador / Estados UnidosEstudio observacional transversal de cuenca hidrográfica (reporte técnico)2024
Detection of carbapenemases in Enterobacterales and other Gram-negative bacilli recovered from hospital and municipal wastewater in Mexico CityUrzua-Abad MM, Aquino-Andrade A, Castelan-Vega JA, Merida-Vieyra J, Ribas-Aparicio RM, Belmont-Monroy L, Jimenez-Alberto A, Aparicio-Ozores GMéxicoEstudio observacional descriptivo (muestreo prospectivo)2024
Citrobacter spp. and Enterobacter spp. as reservoirs of carbapenemase blaNDM and blaKPC resistance genes in hospital wastewaterDuran-Bedolla J, Téllez-Sosa J, Bocanegra-Ibarias P, Schilmann A, Bravo-Romero S, Reyna-Flores F, Villa-Reyes T, Barrios-Camacho HMéxicoEstudio observacional descriptivo con análisis de transferencia plasmídica2024

Tabla 2: Resultado obtenidos

EstudioTipo de aguaMicroorganismos predominantesPatrones de resistenciaFactores asociados
Galarde-López et al., 2022Aguas residuales hospitalarias (crudas y tratadas)E. coli (73.1%); Acinetobacter spp.; Enterobacter spp.MDR; BLEE (blaCTX-M, blaKPC); resistencia a β-lactámicos, fluoroquinolonas, carbapenémicosPersistencia post-tratamiento (WWTP); presión selectiva hospitalaria; diseminación clonal
Ruiz et al., 2025Aguas residuales urbanas + ríos (Suquía, Argentina)E. coli (predominante); Enterobacter spp.; Klebsiella spp.; Citrobacter spp.; Aeromonas spp.MDR; BLEE (blaCTX-M); carbapenemasas (blaKPC, blaNDM); co-resistencia a ciprofloxacino, TMP-SMX, gentamicinaDescargas urbanas; desbordamiento de aguas residuales; transferencia horizontal de genes
Lüneberg et al., 2022Aguas residuales municipales urbanas (Ciudad de México)E. coli resistente a carbapenémicosMDR; blaNDM-5; resistencia a carbapenémicos + co-resistencia (sulfonamidas, trimetoprim, tetraciclina, ciprofloxacino)Plásmidos conjugativos (~145 kb), integrones, transposones; uso de aguas para irrigación
Mendoza-Guido et al., 2025Aguas residuales domésticas – influente/efluente PTAR (Costa Rica)E. coli MDR (8 aislados); filogrupos A y B1; ST205, ST448, ST540, ST2530MDR (100%); BLEE (blaTEM-1, blaCTX-M-115); sul1, sul2, dfrA, tetA, tetB; qnrS1; mutaciones gyrA/parCARGs en plásmidos (77%); integrones clase 1; plásmidos IncH, IncFIB; genes de virulencia (ompT, hlyF)
Rodríguez et al., 2020Aguas residuales domésticas, industriales y hospitalarias (Colombia)Aeromonas spp. (41%); Enterobacter spp. (27%); Klebsiella spp. (8%); Citrobacter spp.; E. coliMDR (91%); blaKPC-2 (100%); resistencia a carbapenémicos (IMP 100%, MEM 98%); ciprofloxacino (44–65%); 21 perfilesMezcla de efluentes humanos, veterinarios e industriales; concentraciones subinhibitorias; PTAR como reservorio
Montenegro et al., 2023Aguas residuales municipales, industriales y hospitalarias – PTAR (Brasil)Klebsiella pneumoniae (18/98); ST11, ST37, ST147, ST244, ST281; CC11 predominanteMDR (39%); XDR (61%); blaKPC (55%), blaNDM (27.8%), blaOXA-370 (11.1%); ≥2 carbapenemasas (42.8%); resistencia universal a ertapenemIncremento de antibióticos (COVID-19); tratamiento secundario insuficiente; plásmidos IncR, IncFII
Medina et al., 2026 (Panamá)Agua superficial (río Juan Díaz) + aguas residuales urbanas sin tratar (WWTP)E. coli (99 aislados: 50 río, 49 WWTP)Aminoglucósidos (80.8%); tetraciclina (37.4%); cloranfenicol (18.2%); tet(A) (86.5%), floR (83.3%), mphA (78%); primer reporte tet(M) en PanamáRío: ARGs en plásmidos; WWTP: ARGs cromosómicos (9/12); descarga sin tratamiento como vía de diseminación
Brodrick et al., 2025 (Costa Rica)Aguas residuales hospitalarias, WWTP y estuario receptorE. coli (116 aislados); Enterococcus spp. (58 aislados); subgrupos: resistentes a ampicilina y MDRE. coli: tetraciclina (75%), TMP-SMX (59%); perfil AMP+TET+SXT frecuente Enterococcus: AMP+TET+CIP o AMP+TET+ERYEfluente sin desinfección; aguas hospitalarias con mayor presión antibiótica
Siqueira et al., 2024 (Brasil)Canales de drenaje urbanos; cuerpos de agua con impacto antropogénico473 familias bacterianas; 83 familias virales; indicadores de contaminación ambiental63 ARGs; resistencia a 13 clases de antimicrobianos; 5 mecanismos de resistenciaFalta de políticas ambientales; deficiente educación ambiental; contaminación química (Cd, Fe, Mn)
Estheysi et al., 2025 (Perú)Efluentes hospitalarios (pre-descarga al alcantarillado)Enterobacterias Gram negativas; Salmonella enterica; Stenotrophomonas maltophilia; bacterias MDRBLEE (blaTEM, blaCTX-M, blaSHV); AmpC (blaAmpC); carbapenemasas (blaKPC, blaNDM, blaIMP)Uso excesivo de antibióticos; ausencia de tratamiento adecuado; vigilancia epidemiológica deficiente
Ruiz et al., 2025 (Argentina) – Laguna SalíaAguas residuales urbanas; río Suquía; Laguna Salía; estuariosE. coli (predominante); Enterobacter spp.; Klebsiella spp.; Citrobacter spp.; Aeromonas caviaeBLEE (blaCTX-M); carbapenemasas (blaKPC-2, blaNDM-1); plásmidos IncU, IncA/C2; MDR generalizadaDesbordamiento en calles; descarga directa al río; carga fecal 10⁸ MPN/100 mL; fallos en alcantarillado
Aguilar-Rangel et al., 2025 (Chile)Aguas residuales hospitalarias sin tratamientoAeromonas spp. (7 cepas, predominante); K. pneumoniae (3); E. coli (1); Pseudomonas spp. (1); Enterococcus faecium (1)MDR (40%); 121 ARGs en 31 clases; cefalosporinas (11.6%), penams (10.76%), macrólidos (9.89%); inactivación enzimática y bombas de eflujoAusencia de tratamiento; ARGs en plásmidos e integrones; paracetamol detectado (277.4 µg/L)
Soriano-Moreno et al., 2021 (Perú)Aguas residuales hospitalarias sin tratamiento32 cepas: Enterobacter cloacae (30%), E. coli (25%), Citrobacter freundii (20%); 20 enterobacterias (62.5%)MDR (100%); BLEE (blaTEM, predominante); carbapenemasas (blaKPC, blaIMP)Ausencia de tratamiento; mayor carga en hospital nivel III
Silva et al., 2022 (Brasil)Aguas superficiales urbanas con influencia hospitalaria y doméstica (Río Carioca, 5 puntos)E. coli (100% puntos positivos); 99.9% muestras positivas para coliformesSin BLEE ni carbapenemasas; resistencia fenotípica a AMP, CIP, LEV, TMP-SMX solo en punto más impactado (punto 5)Descarga de efluentes sin tratamiento; saneamiento deficiente
Corrales-Martínez et al., 2024 (Ecuador)Agua de riego agrícola (canal de irrigación, Cayambe)60 aislados Enterobacteriaceae ; 1 Enterobacter kobei ST2070 productor de carbapenemasaMDR; BLEE (blaCTX-M-12); carbapenemasas (blaOXA-10, blaKPC-2); aac(6')-lb, sul2, dfrA14, fosA, msr(E), mph(A)Aguas residuales urbanas y ganadería; riesgo de diseminación a cadena alimentaria
Montero et al., 2021 (Ecuador)Aguas de riego agrícola y productos frescos (17 provincias)E. coli (165 aislados); 96/165 (58%) fenotipo BLEE, 58% procedentes de agua de riegoMDR (94%); blaCTX-M (96%): CTX-M-55 (64%), CTX-M-65 (18%); blaTEM (92%), blaSHV (28%); mcr-1 en 3 aisladosAguas residuales sin tratamiento para riego; elementos móviles; falta de infraestructura en Ecuador
Reichert et al., 2019 (América Latina)Agua potable, superficial y residuales urbanas (Brasil, México, Argentina, Chile, Colombia)No especificados a nivel de especie; presencia de ARGsARGs priorizados: tetraciclina, amoxicilina, norfloxacina, ampicilina, imipenemSistemas de tratamiento ineficientes; WWTP como fuente principal; ausencia de listas de contaminantes prioritarios
Ramalho et al., 2022 (Brasil)Agua potable pre/post-tratamiento; aguas residuales STP y SPP (invierno y verano)No se identificaron especies específicas; ARGs en 100% de aguas residuales, sin variación estacionalCarbapenemasas (blaNDM-1, blaKPC-2); BLEE (blaTEM, blaCTX-M); mcr-1 (100% muestras STP/SPP)Tratamiento insuficiente; uso excesivo de antibióticos; transferencia por bacteriófagos y elementos móviles
Rodríguez Guevara et al., 2025 (Panamá)Agua superficial urbana (Río Matasnillo) y aguas residuales crudas (WWTP Juan Díaz)E. coli predominante; río: 100% filogrupo A; WWTP: 72% A, 12% D, 6% B2; patotipos ETEC (12%) y EHEC (18%) en WWTPWWTP: MDR (94%); alta resistencia a cefalosporinas; 41% intermedia a carbapenémicos; qnrB19 en río; quinolonas bajas en río (8%)Contaminación fecal urbana e industrial; descarga sin tratamiento; diseminación de qnrB19 por plásmidos
Galdamez et al., 2026 (Belice)18 sitios: cuenca río Belice, costa, arrecifes BBRRS, Atolón Glover's Reef (ago–sep 2022)ESBL-EC en sitios con altos ARGs; metagenómica: bacterias fecales (Bacteroides, Faecalibacterium) y de agua dulceqPCR: sul1, sul2, tetA, ermF, blaSHV, intI1 en 18 sitios; 17 clases ARGs; máximos en Haulover Creek y zonas costeras; presentes incluso en arrecifes remotosNiveles altos cerca de lagunas de tratamiento; ARGs en ecosistemas remotos (arrecifes)
Gonçalves et al., 2024 (Brasil)Efluentes hospitalarios (n=42) y no hospitalarios (n=16); muestreo mensual 6 mesesCRE: K. pneumoniae, Enterobacter cloacae y otras Enterobacteriaceae ; 16 productores de carbapenemasa (todos hospitalarios)MDR; blaKPC-2 (100% de 16 aislados); resistencia a carbapenémicos, cefalosporinas, pip/tazo, CIP, aminoglucósidos; 2 aislados panresistentes (incl. CZA y C/T)Efluentes hospitalarios sin tratamiento; regulación deficiente; diseminación de blaKPC-2 por clones y plásmidos
Ayzanoa et al., 2026 (Perú)Aguas residuales hospitalarias (26 muestras, 113 aislamientos) y urocultivos/ hemocultivos UCI pediátricaE. coli (113) y Klebsiella spp. (44); mayor diversidad en aguas residuales (H=3.45 vs 2.95); ST compartidos: ST88, ST101E. coli: más BLEE en clínicos; carbapenemasas y mcr-1 solo en aguas residuales/ orina; Klebsiella: carbapenemasas solo en aguas residualesInfraestructura limitada; alto uso de antibióticos en UCI; stewardship insuficiente; transferencia horizontal de genes
Rodríguez E & Jiménez JN, 2023Múltiple: residuales urbanas, hospitalarias, agrícolas, recreativas y potableE. coli; Pseudomonas aeruginosa; Acinetobacter spp.; K. pneumoniae; Aeromonas spp.BLEE (blaCTX-M, blaTEM, blaSHV); carbapenemasas (blaKPC, blaNDM, blaOXA-48); ARGs: quinolonas, tetraciclinas, sulfonamidasUso excesivo de antibióticos; ausencia de tratamiento; actividades agrícolas, ganaderas y acuicultura; efluentes farmacéuticos
De Oliveira Gomes et al., 2022Aguas residuales domésticas y muestras clínicas (urocultivos hospitalarios)E. coli (aislados clínicos y ambientales); UPEC predominante en muestras clínicasResistencia a aminoglucósidos (amikacina, gentamicina, neomicina); BLEE (ESBL); AME: aph(3'), aac(3'), aac(6')-IUso indiscriminado de aminoglucósidos; ungüentos de neomicina (Brasil); presión selectiva clínica; transferencia vía plásmidos/ transposones
Aristizábal-Hoyos et al., 2019 (PTAR Colombia)Aguas residuales urbanas – PTAR: afluente, aireación, lodo recirculado, efluente finalE. coli (83%); Citrobacter freundii (11%); Enterobacter cloacae (4%); K. pneumoniae (1%)BLEE: blaCTX-M-g1 (35.8%), blaTEM (43.8%), blaSHV (3.6%), blaCTX-M-g9 (8.8%); AmpC: LAT/ BIL/CMY (78.3%), ACT/MIR (17.4%); sin carbapenemasasTratamiento biológico insuficiente; concentraciones subinhibitorias en PTAR; presión selectiva continua
Aristizabal-Hoyos et al., 2022 (HWW Colombia)Aguas residuales hospitalarias (UCI, UCE, hospitalización) – PTAR hospitalaria (Hospital B)Citrobacter freundii (21.1%); E. coli (16.7%); K. pneumoniae (13.3%); 33.3% identificado del totalMDR (97.7%); >50% resistentes a ≥9 categorías; BLEE: blaTEM (48.3%), blaCTX-M-g1 (10.8%); carbapenemasas: blaKPC (88.7%), blaNDM (5.2%), blaVIM (1.9%)Sin PTAR en mayoría de hospitales colombianos; resistencia endémica; alto uso de antibióticos de amplio espectro; descarga directa a alcantarillado
VanderYacht et al., 2024 (Ecuador)Agua superficial glacial para riego; upstream (sin contaminación) y downstream (postdescarga urbana); lechuga irrigadaE. coli (principal); Enterobacter cloacae (4 casos, blaACT-12); 2 no-Enterobacterale s con ARGs a carbapenémicosBLEE: blaCTX-M-65 (29%), blaCTX-M-14b (14.7%), blaCTX-M-8 (11.8%), blaTEM; 91.7% ≥1 gen β-lactámico; blaOXA-427 en lechugaSolo 31% de aguas residuales tratadas en Ecuador; urbanización sin infraestructura sanitaria; agua contaminada para riego
Urzua-Abad et al., 2024 (México)Aguas residuales municipales (canales) y hospitalarias (hospital pediátrico), Ciudad de MéxicoAeromonas sp. (n=10); K. pneumoniae (n=8, Canal 1); E. coli (n=7, Canal 2); Enterobacter spp. (n=5); Pseudomonas putida (n=6); Citrobacter spp.; primeros reportes de carbapenemasas en Lelliottia, Kluyvera, ShewanellaMDR (100% Enterobacterales); carbapenemresistentes (92%); blaKPC (55%), blaNDM (12%), blaVIM-2 (12%), blaOXA-48 (4%); BLEE: blaTEM (24%), blaCTX-M-1 (18%), blaSHV (8%)4 hospitales en Canal 1 vs 1 en Canal 2; resistencia endémica a carbapenémicos en México; efluentes sin tratamiento; vigilancia AMR insuficiente
Duran-Bedolla et al., 2024 (México)Aguas residuales hospitalarias brutas – 5 hospitales COVID-19 (distintos estados de México)E. coli (32.9%); Enterobacter spp. (24.6%); Citrobacter spp. (14.4%) = 71.9% total; K. pneumoniae; Acinetobacter spp.; Pseudomonas spp.BLEE: blaTEM (33.1%), blaCTX-M (25.4%), blaSHV (5.3%), blaOXA-48 (1.1%); carbapenemasas: blaKPC (25.4%), blaNDM (8.8%); blaNDM predomina en Enterobacter spp. (91% en E. cloacae/ xiangfangensis); co-producción blaNDM+blaOXA-48Uso continuo de antibióticos; concentraciones subletales en efluentes; plásmidos IncFII (110 kb); hospitalización COVID-19

Síntesis narrativa

1.1 Microorganismos predominantes en matrices acuáticas

Escherichia coli emergió como el microorganismo predominante en la totalidad de los estudios analizados, independientemente del tipo de matriz hídrica. Las prevalencias oscilaron entre 25 % en efluentes hospitalarios peruanos(1) y 73,1 % en aguas residuales hospitalarias de México(2), constituyendo además el principal indicador de contaminación fecal en matrices superficiales y de riego. En segundo plano, con frecuencias considerables, se identificaron Klebsiella pneumoniae, Enterobacter spp., Aeromonas spp. y Citrobacter spp. En Colombia, Aeromonas spp. (41 %) precedió a E. coli en matrices que mezclan efluentes domésticos, industriales y hospitalarios(3), evidenciando perfiles polimicrobianos vinculados a la heterogeneidad de los aportes orgánicos. Los análisis metagenómicos han permitido ampliar de manera considerable este panorama. En Brasil, Siqueira et al.(4) reportaron la presencia de 473 familias bacterianas en canales de drenaje urbano, mientras que Aguilar-Rangel et al.(5) identificaron 56 familias de genes de resistencia en aguas residuales hospitalarias sin tratamiento en Chile. Asimismo, Urzua- Abad et al.(6) documentaron por primera vez la detección de carbapenemasas en Shewanella putrefaciens, Lelliottia amnigena y Kluyvera cryocrescens en canales que reciben efluentes hospitalarios en Ciudad de México. Este hallazgo amplía el rango de posibles hospederos de genes de resistencia considerados de importancia crítica.

1.2 Patrones de resistencia antimicrobiana y genes de resistencia identificados

Las beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) representaron el mecanismo de resistencia reportado con mayor frecuencia en los diferentes países y matrices analizados, observándose un predominio del gen blaCTX-M. Este patrón fue descrito en estudios realizados en Argentina(7), Brasil(8), Colombia(9), Costa Rica(10), Ecuador(11,12), México(2), Panamá(13,14) y Perú(1,15). En Ecuador, Montero et al.(11) hallaron que el 96 % de los aislados BLEE portaban blaCTX-M, con las variantes CTX-M-55 (64 %) y CTX-M-65 (18%) como dominantes; esta última fue también la más frecuente en aguas de riego agrícola de Perú(16). El gen blaTEM apareció como co-portador en la mayoría de los estudios,(8,9,16), y blaSHV con menor frecuencia relativa.

Las carbapenemasas representaron el hallazgo de mayor alarma clínica y epidemiológica. El gen blaKPC fue el más frecuentemente reportado, con distribución en Brasil(18,19), Colombia(3,

20), México(6,17) y Perú(18). En Brasil, Montenegro et al.(19) documentaron que el 55 % de los aislados de K. pneumoniae en plantas de tratamiento de aguas residuales (PTAR) portaban blaKPC, con un 42,8 % co-produciendo dos o más carbapenemasas simultáneamente. Gonçalves et al.(20) hallaron blaKPC-2 en el 100 % de los 16 aislados productores de carbapenemasa en efluentes hospitalarios, dos de los cuales resultaron pan-resistentes, incluyendo resistencia a ceftazidima/avibactam y ceftolozane/tazobactam. Las metalo-beta-lactamasas blaNDM se documentaron en México (NDM-5 en plásmidos de ~145 kb)(21), Brasil(8,19), Argentina(7) y Colombia(23); su co-producción con blaOXA-48 en Enterobacter spp. de hospitales COVID-19 en México configura escenarios de pandeterminancia terapéutica(17). Con menor frecuencia se reportaron blaVIM (México(6), Colombia(22)), blaIMP (Colombia(23), Perú(18)) y blaOXA-370 (Brasil(19)). La multirresistencia (MDR) fue prácticamente universal —91–100 % en la mayoría de estudios—; el 61 % de los aislados de K. pneumoniae en Brasil fueron XDR(19). El gen mcr-1, conferidor de resistencia a polimixinas (último recurso terapéutico), fue detectado en Ecuador(11) y en el 100 % de las muestras de PTAR en Brasil(8). Adicionalmente, se identificaron genes de resistencia a sulfonamidas (sul1, sul2), trimetoprim (dfrA), tetraciclinas (tetA, tetB, tetM) y aminoglucósidos en múltiples matrices y países(10,13,14).

1.3 Tipo de fuente hídrica y carga diferencial de resistencia

Los estudios que compararon distintas matrices hídricas evidenciaron una jerarquía de contaminación en términos de carga de genes de resistencia antimicrobiana (ARGs) y microorganismos resistentes. Las aguas residuales hospitalarias sin tratar mostraron consistentemente los perfiles más complejos: MDR en el 100 % de los aislados en Perú(1) y Colombia(23), con predominio de carbapenemasas. Ayzanoa et al.(18) compararon aislamientos clínicos (UCI pediátrica) y ambientales en Perú, observando que las carbapenemasas aparecían exclusivamente en las aguas residuales, lo que sugiere transferencia bidireccional hospital-ambiente. Los cuerpos de agua que reciben descargas urbanas sin tratamiento, entre ellos el río Juan Díaz (Panamá)(13), el río Suquía (Argentina)(7) y el río Matasnillo (Panamá)(14), registraron concentraciones fecales de hasta 108 NMP/100 mL con perfiles de ARGs equiparables a los hallados en aguas residuales sin tratar. En el ámbito agrícola, el agua de riego representa un punto de conexión directo con los alimentos: estudios en Ecuador identificaron un 58 % de los aislamientos productores de BLEE provenían de canales de irrigación(11), mientras que en Perú se encontró el gen blaCTX-M-65 en lechugas cultivadas con este tipo de agua(16). Las PTAR, aunque reducen parcialmente la carga bacteriana, demostraron limitaciones estructurales para eliminar ARGs: Ramalho et al.(8) confirmaron carbapenemasas y mcr-1 en efluentes tratados en Brasil, y Aristizábal-Hoyos et al.(22) evidenciaron persistencia de blaCTX-M y blaTEM en todas las etapas del tratamiento convencional en Colombia.

1.3 Mecanismos de diseminación: transferencia horizontal de genes y elementos móviles

Si bien las plantas de tratamiento de aguas residuales logran disminuir parcialmente la carga bacteriana, varios estudios latinoamericanos han puesto en evidencia su incapacidad para eliminar los ARGs de forma consistente. Respecto a los mecanismos de propagación, los elementos genéticos móviles, los Plásmidos conjugativos de los grupos IncFII, IncH, IncR e integrones de clase 1, constituyeron los principales vectores de transferencia horizontal de genes(10,19). En Costa Rica, el 77 % de los ARGs se localizaron en plásmidos, y en México se identificaron plásmidos portadores de blaNDM asociados a integrones y transposones(21). La diseminación clonal y

la posible intervención de bacteriófagos amplifican este fenómeno, favoreciendo la persistencia y a su vez expansión de la resistencia en distintos ecosistemas acuáticos.

1.5 Factores contextuales y determinantes estructurales de la resistencia ambiental

El factor más frecuentemente señalado como condicionante estructural de la resistencia ambiental fue la ausencia o insuficiencia del tratamiento de aguas residuales (1,9,18,19,22–24). Esta situación se concreta en datos como la cobertura de saneamiento del 31 % registrada en Ecuador(16) o la falta de PTAR en la mayoría de hospitales colombianos(22). El uso excesivo e inapropiado de antibióticos en los ámbitos humano y veterinario fue señalado como principal generador de presión selectiva(7,8,11,12,14,23), mientras que las concentraciones subinhibitorias en efluentes promueven la transferencia horizontal de ARGs sin ejercer presión letal directa(17,22,23). Montenegro et al.(19) documentaron un incremento en la diversidad de carbapenemasas en PTAR brasileñas durante la pandemia COVID-19, vinculado al mayor uso de antimicrobianos de amplio espectro. La deficiencia de vigilancia epidemiológica ambiental, el subregistro clínico y la falta de políticas públicas armonizadas completan el cuadro de vulnerabilidad estructural de la región(4,13,14,18).

1.6 Distribución geográfica y heterogeneidad regional

El análisis de la literatura incluyó estudios procedentes de 10 países de América Latina y el Caribe: Argentina, Belice, Brasil, Chile, Colombia, Costa Rica, Ecuador, México, Panamá y Perú. Brasil concentró el mayor número de estudios (n=5), seguido de México (n=4), Colombia, Perú y Ecuador (n=3), mientras que Panamá, Costa Rica y Argentina aportaron dos estudios cada uno, y Chile y Belice contribuyeron con un estudio respectivamente. Los hallazgos evidenciaron una marcada heterogeneidad regional en la distribución y diversidad de genes de resistencia antimicrobiana en matrices ambientales.

Figura 2. Distribución geográfica de la resistencia antimicrobiana ambiental en América Latina y el Caribe
Mapa de distribución geográfica de la resistencia antimicrobiana ambiental

 Nota: ARGs: genes de resistencia antimicrobiana. MDR: multirresistente. XDR: extremadamente resistente. Escala basada en revisión sistemática. Los círculos representan la intensidad acumulada de resistencia por país.

El mapa muestra la intensidad de resistencia antimicrobiana ambiental en 10 países de la región, basada en el número de estudios, diversidad de ARGs y fenotipos MDR/XDR reportados. Brasil y México representan los puntos con mayor intensidad (rojo), concentrando mayor número de estudios (n=5 y n=4 respectivamente) y la mayor diversidad de genes de resistencia críticos. Colombia, Perú y Argentina presentan intensidad media-alta (naranja), mientras que Panamá, Ecuador y Costa Rica muestran intensidad moderada (amarillo). Chile y Bélice presentan la menor intensidad regional, aunque el último destaca por detección de ARGs en arrecifes de coral a cientos de km de fuentes urbanas, evidenciando la capacidad de dispersión de estos genes.

Con el fin de caracterizar los patrones de distribución de ARGs específicos por país, se analizó la frecuencia de detección de doce genes de resistencia en las matrices ambientales reportadas.

Figura 3. Distribución de genes de resistencia antimicrobiana en América Latina y el Caribe
Gráfico de distribución de genes de resistencia antimicrobiana

El análisis de la frecuencia de ARGs por país reveló patrones diferenciados según la subregión. Brasil y Colombia presentaron la mayor intensidad de carbapenemasas, con blaKPC en valor crítico(4) y co-detección de blaNDM y mcr-1. México destacó por la mayor cantidad de genes detectados, con blaNDM dominante(4). En la parte sur, Argentina y Chile mostraron predominio de blaKPC y blaNDM, mientras que Ecuador, Panamá y Costa Rica presentaron blaCTX-M como gen prevalente. Belice, pese a tener la menor carga, registró sul1/sul2 y blaNDM en matrices ambientales remotas(24).

Los genes de carbapenemasas detectados: blaKPC, blaNDM, blaOXA-370 y blaVIM, confieren resistencia a carbapenémicos de última línea, siendo relevante la co-producción simultánea de los tres primeros documentada en K. pneumoniae de PTAR brasileñas. El gen mcr-1, detectado en el 100% de las muestras de PTAR en Brasil y en canales de riego de Ecuador, otorga resistencia a la colistina, último recurso terapéutico disponible para infecciones por gram-negativos multirresistentes. El gen blaCTX-M, predominante en Ecuador, Perú y Colombia confiere resistencia a cefalosporinas de tercera generación y fue el único ARG con presencia ininterrumpida en todas las fases de tratamiento de la PTAR evaluadas en Colombia. Los genes tet(M), reportados por primera vez en Panamá en el 83.3% de los aislados de E.coli, y sul1/sul2 detectados en arrecifes de coral en Belice confieren resistencia a tetraciclinas y sulfonamidas respectivamente. El gen intl1, co-detectado en varios países no confiere resistencia directa, pero actúa como elemento móvil que facilita la transferencia horizontal de todos los ARGs mencionados entre bacterias del ambiente.

Análisis y discusión

Los hallazgos de esta revisión sistemática convergen con la posición de la Organización Mundial de la Salud (OMS), que en su Plan de Acción Mundial sobre la Resistencia a los Antimicrobianos reconoce el nexo entre la resistencia clínica y la contaminación ambiental dentro del enfoque «Una sola salud» (One Health).(25) La presencia de E. coli BLEE en el 58 % de las muestras de agua de riego en Ecuador(10) y de E. coli BLEE en lechuga irrigada con agua contaminada en Perú(16) confirma el principio de que los ambientes acuáticos impactados por actividades humanas actúan como reservorios y vectores de diseminación de ARGs hacia la cadena alimentaria y, en última instancia, hacia la población general. Este mecanismo fue anticipado por estudios seminales como el de Van Boeckel et al.,(8) quienes proyectaron un incremento del 67 % en el consumo global de antibióticos para 2030, con América Latina como una de las regiones de mayor crecimiento relativo, amplificando la presión selectiva tanto en entornos clínicos como ambientales.

El hallazgo más preocupante desde la perspectiva clínica y de salud pública es la amplia diseminación de carbapenemasas en efluentes hospitalarios y en plantas de tratamiento de aguas residuales (PTAR). Se ha reportado que un 55% de aislados de K.pneumoniae en PTAR en Brasil portan el gen blaKPC(19); además, se ha detectado el gen mcr-1 que confiere resistencia a polimixinas y es un antibiótico de último recurso en un 100% de las muestras de PTAR brasileñas(7,26). Los reportes han dejado evidencia de que los sistemas de tratamiento tienen un papel relevante en el incremento de la resistencia. Estos datos muestran una disparidad con los estándares requeridos por la Directiva Europea TARU 2024/3019, la cual establece tratamientos cuaternarios (oxidación avanzada, membranas) y control constante de ARGs en efluentes(27), mientras que los resultados que se observan, muestran que la regulación ambiental sigue basada

en parámetros fisicoquímicos tradicionales como DBO y DQO en América Latina, sin incluir bacterias resistentes (ARB) ni ARGs. Según Hossain y Ahmed(28), se señala que esta brecha regulatoria convierte a los hospitales de países de ingresos bajos y medios en focos discretos de la crisis superbacteriana, observación que refleja la situación latinoamericana reportada en los estudios incluidos.

En cuanto a las fortalezas de la evidencia revisada, es relevante destacar la cobertura multipaís y la diversidad de matrices hídricas analizadas, lo que permite proyectar conclusiones con cierta solidez regional. Aún así, persisten limitaciones importantes: la diversidad metodológica entre estudios dificulta comparaciones cuantitativas precisas en lo que respecta a técnicas de aislamiento, umbrales de identificación y criterios de definición de MDR/XDR. La cobertura geográfica es desequilibrada, con sobre-representación de Brasil, Colombia y México frente a países con escasa investigación ambiental publicada. Además, gran parte de estos estudios presentan muestras de tamaño reducido y diseños transversales, lo que dificulta extraer inferencias sobre tendencias temporales(29). Asimismo, otra brecha que persiste es la carencia de evidencia que logre relacionar entre cepas ambientales resistentes e infecciones concretas en humanos.

Las implicaciones para la práctica profesional y las políticas de salud pública son considerables. Inicialmente, la detección de carbapenemasas y del gen mcr-1 en aguas de riego agrícola y en lixiviados que alcanzan ríos de uso recreativo y consumo humano establece una vía de exposición directa de la población general, lo que precisa incorporar la vigilancia ambiental de ARGs dentro de los sistemas nacionales de vigilancia epidemiológica de la RAM. Es pertinente destacar que el enfoque One Health que incluye la salud humana, animal y ambiental se ha vuelto indispensable para una respuesta verdaderamente eficaz(22,28,29).Vallejos y Pérez(29) sostienen que, en Perú y América Latina, las estrategias One Health deben ir acompañadas de inversiones en infraestructura de saneamiento y con capacitación intersectorial. La justificación a este razonamiento es que la RAM amenaza no solo la eficacia terapéutica, sino también la estabilidad macroeconómica: el Banco Mundial proyecta pérdidas de PIB comparables a las de grandes crisis financieras para 2050 si no se toman medidas con urgencia(29). En tercer lugar, experiencias como el Proyecto EMERGENTcy (España-Francia-Andorra, 2021-2027) que junta monitoreo sistemático en 45 puntos de muestreo más procesos de oxidación avanzada (POA) y gobernanza multisectorial(27,30) ofrecen un modelo replicable para la región, adaptado a contextos de menor capacidad institucional mediante tecnologías costo-efectivas en origen. Por último, la epidemiología basada en aguas residuales (WBE) se presenta como una herramienta de bajo costo y alta sensibilidad para la detección temprana de brotes de cepas resistentes, con potencial de incorporarse a planes nacionales de acción contra la RAM que, en muchos países latinoamericanos aún no han sido implementados(28).

Conclusión

Los resultados de esta revisión confirman que la descarga de aguas residuales presenta una fuente relevante y documentada de diseminación de resistencia antimicrobiana en América Latina. Los estudios incluidos muestran con consistencia y en distintos contextos nacionales, que los cuerpos de agua receptores de efluentes urbanos y hospitalarios concentran enterobacterias multirresistentes portadoras de genes de resistencia de relevancia clínica crítica.

El microorganismo que más frecuente se identificó fue E. coli, lo que resulta alarmante es su perfil de resistencia, pues posee genes como blaCTX-M, blaKPC y blaNDM, algunos de los cuales otorgan resistencia a los últimos antibióticos disponibles. La co-producción de múltiples carbapenemasas en K.pneumoniae de Brasil, o la detección de mcr-1 en el total de las PTAR analizadas en ese mismo país, muestran un escenario que hoy en día aparece como un patrón regional.

Cabe destacar también los canales de riego agrícola de Ecuador y Perú, donde estos genes avanzan a los productos que consume la población. De esta manera, la resistencia antimicrobiana ambiental es un problema que ya no es exclusivo del sistema de salud, sino que también se instaura en el día a día de la población.

Frente a esta situación, se puede concluir que las acciones sectoriales y aisladas no son suficientes. Se requiere incorporar vigilancia de ARGs en los sistemas epidemiológicos nacionales, actualizar marcos regulatorios más allá de los parámetros tradicionales, e invertir en infraestructura de saneamiento con tecnología capaz de eliminar material genético resistente. Todo lo mencionado, bajo el enfoque One Health que reconozca que la salud humana, animal y ambiental no pueden abordarse de manera separada.

Agradecimientos

Los autores expresan su sincero agradecimiento al Doctor José Patricio Beltrán Carreño y a la Ingeniera Johanna Priscila Tacuri Campoverde por su orientación académica, las ideas aportadas y la guía brindada a lo largo del desarrollo de esta investigación. Su retroalimentación constante y criterio fueron fundamentales para la realización de este trabajo.

Financiamiento

Los autores declaran no haber recibido financiamiento externo para el desarrollo de este trabajo.

Conflicto de intereses

Los autores declaran no tener conflicto de intereses con ninguna fuente externa. Este trabajo fue realizado en el marco académico sin financiamiento externo ni vínculos con otras organizaciones.

Referencias

  1. Soriano-Moreno DR, Yareta J, Rojas-Cosi AF, Fajardo-Loyola A, León-Luna D, Castillo-Quezada I, et al. Efluentes hospitalarios como reservorio de enterobacterias productoras de betalactamasas y carbapenemasas. Rev Peru Med Exp Salud Pública. 14 de abril de 2021;38(2):302-7. doi: 10.17843/rpmesp.2021.382.6202  
  2. Galarde-López M, Velazquez-Meza ME, Bobadilla-del-Valle M, Cornejo-Juárez P, Carrillo-Quiroz BA, Ponce-de-León A, et al. Antimicrobial Resistance Patterns and Clonal Distribution of E. coli, Enterobacter spp. and Acinetobacter spp. Strains Isolated from Two Hospital Wastewater Plants. Antibiotics. 29 de abril de 2022;11(5):601. doi: 10.3390/antibiotics11050601  
  3. Rodríguez EA, Garzón LM, Gómez ID, Jiménez JN. Multidrug resistance and diversity of resistance profiles in carbapenem-resistant Gram-negative bacilli throughout a wastewater treatment plant in Colombia. J Glob Antimicrob Resist. septiembre de 2020;22:358-66. doi: 10.1016/j.jgar.2020.02.033  
  4. Siqueira JAM, Teixeira DM, da Piedade GJL, Souza C de O, Moura TCF, Bahia M de NM, et al. Environmental health of water bodies from a Brazilian Amazon Metropolis based on a conventional and metagenomic approach. J Appl Microbiol. 1 de mayo de 2024;135(5):lxae101. doi: 10.1093/jambio/lxae101 PubMed PMID: 38627246.  
  5. Aguilar-Rangel EJ, Paredes-Cárcamo F, Andrade MD, Contreras-Sánchez D, Rain-Medina V, Campanini-Salinas J, et al. Hospital Wastewater as a Reservoir of Contaminants of Emerging Concern: A Study Report from South America, Chile. Antibiotics. 4 de noviembre de 2025;14(11):1111. doi: 10.3390/antibiotics14111111  
  6. Urzua-Abad MM, Aquino-Andrade A, Castelan-Vega JA, Merida-Vieyra J, Ribas-Aparicio RM, Belmont-Monroy L, et al. Detection of carbapenemases in Enterobacterales and other Gram-negative bacilli recovered from hospital and municipal wastewater in Mexico City. Sci Rep. 4 de noviembre de 2024;14(1):26576. doi: 10.1038/s41598-024-76824-w PubMed PMID: 39496672; PubMed Central PMCID: PMC11535501.  
  7. Ruiz SE, Morandini FN, Panzetta ME, Lipari FG, Irrazábal MG, Toselli R, et al. Urban wastewater overflows as hotspots for dissemination of bacteria producing extended-spectrum β-lactamases and carbapenemases in the Suquía River, Argentina. Front Microbiol. 2025;16:1669531. doi: 10.3389/fmicb.2025.1669531 PubMed PMID: 41070122; PubMed Central PMCID: PMC12504239.  
  8. Ramalho R, Mezzomo LC, Machado W, da Silva Morais Hein C, Müller CZ, da Silva TCB, et al. The occurrence of antimicrobial residues and antimicrobial resistance genes in urban drinking water and sewage in Southern Brazil. Braz J Microbiol Publ Braz Soc Microbiol. septiembre de 2022;53(3):1483-9. doi: 10.1007/s42770-022-00786-2 PubMed PMID: 35764766; PubMed Central PMCID: PMC9433623.  
  9. Aristizábal-Hoyos AM, Rodríguez EA, Arias L, Jiménez JN. High clonal diversity of multidrug-resistant and extended spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli in a wastewater treatment plant. J Environ Manage. 1 de septiembre de 2019;245:37-47. doi: 10.1016/j.jenvman.2019.05.073 PubMed PMID: 31150908.  
  10. Mendoza-Guido B, Rivera-Montero L, Barrantes K, Chacon L. Plasmid and integron-associated antibiotic resistance in Escherichia coli isolated from domestic wastewater treatment plants. FEMS Microbiol Lett. 10 de enero de 2025;372:fnaf041. doi: 10.1093/femsle/fnaf041  
  11. Montero L, Irazabal J, Cardenas P, Graham JP, Trueba G. Extended-Spectrum Beta-Lactamase Producing-Escherichia coli Isolated From Irrigation Waters and Produce in Ecuador. Front Microbiol. 2021;12:709418. doi: 10.3389/fmicb.2021.709418 PubMed PMID: 34671324; PubMed Central PMCID: PMC8521160.  
  12. Corrales-Martínez J, Jaramillo K, Tadesse DA, Satán C, Villavicencio FX, Sánchez-Gavilanes L, et al. Genomic characterization of a WHO critical priority isolate Enterobacter kobei ST2070 harboring OXA-10, KPC-2, and CTX-M-12 recovered from a water irrigation channel in Ecuador. Heliyon. 15 de marzo de 2024;10(5):e26379. doi: 10.1016/j.heliyon.2024.e26379 PubMed PMID: 38449644; PubMed Central PMCID: PMC10915343.  
  13. Medina-Sánchez JR, Salvatierra M, Espino CI, Martínez-Torres AO, Llanes A, Querol-Audi J. Prevalence and Differential Plasmid Versus Chromosomal Distribution of Ribosome-Targeting Antibiotic Resistance Genes in Escherichia coli Isolates from River and Untreated Wastewater Environments. Antibiotics. 28 de enero de 2026;15(2):132. doi: 10.3390/antibiotics15020132 PubMed PMID: 41750430; PubMed Central PMCID: PMC12937253.  
  14. Rodríguez Guevara GA, Michelangelli E, Medina-Sánchez JR, Mejía-Meléndez F, Espino CI, Moreno P JE, et al. Determination of Phylogroups, Pathotypes and Antibiotic Resistance Profiles of E. coli Isolates from Freshwater and Wastewater in the City of Panama. Pathogens. 20 de junio de 2025;14(7):617. doi: 10.3390/pathogens14070617 PubMed PMID: 40732665; PubMed Central PMCID: PMC12299560.  
  15. Elías Solís GE, Wong Cabanillas O, Hinostroza Cordova R, Mamani Poma MC, Maquera Canales A, Hernandez Gutierrez F, et al. Enterobacterias multidrogoresistentes productoras de betalactamasas de espectro extendido, Ampc y Carbapenemasas aislados de efluentes hospitalarios del Perú. Rev Cuerpo Méd Hosp Nac Almanzor Aguinaga Asenjo. 18 de mayo de 2025;18(1). doi: 10.35434/rcmhnaaa.2025.181.2594  
  16. VanderYacht T, Salinas L, Remerleitch T, Walas N, Ho T, Trueba G, et al. Lack of wastewater treatment in a small town drives the spread of ESBL-producing Escherichia coli in irrigation waters. J Environ Qual. 2024;53(6):1116-26. doi: 10.1002/jeq2.20641 PubMed PMID: 39428701.  
  17. Duran-Bedolla J, Téllez-Sosa J, Bocanegra-Ibarias P, Schilmann A, Bravo-Romero S, Reyna-Flores F, et al. Citrobacter spp. and Enterobacter spp. as reservoirs of carbapenemase blaNDM and blaKPC resistance genes in hospital wastewater. Appl Environ Microbiol. 21 de agosto de 2024;90(8):e0116524. doi: 10.1128/aem.01165-24 PubMed PMID: 39012101; PubMed Central PMCID: PMC11337798.  
  18. Ayzanoa B, Castillo-Vilcahuaman C, Salvatierra G, Dávila-Barclay A, Cuicapuza D, Huancachoque J, et al. Genomic surveillance of multidrug-resistant Escherichia coli and Klebsiella in clinical and wastewater isolates from a paediatric hospital in Lima, Peru. Access Microbiol. 1 de enero de 2026;8(1). doi: 10.1099/acmi.0.001006.v3  
  19. Montenegro K, Flores C, Nascimento APA, Farias BO, Brito ASG, Magaldi M, et al. Occurrence of Klebsiella pneumoniae ST244 and ST11 extensively drug-resistant producing KPC, NDM, OXA-370 in wastewater, Brazil. J Appl Microbiol. 4 de julio de 2023;134(7):lxad130. doi:10.1093/ jambio/lxad130 PubMed PMID: 37391364.  
  20. Gonçalves DLDR, Chang MR, Nobrega GD, Venancio FA, Higa Júnior MG, Fava WS. Hospital sewage in Brazil: a reservoir of multidrug-resistant carbapenemase-producing Enterobacteriaceae. Braz J Biol. 2024;84:e277750. doi: 10.1590/1519-6984.277750  
  21. Lüneberg K, Amábile-Cuevas CF, Mucito-Varela E, Martínez L, Salinas E, López-Vidal Y, et al. Metallo-beta-lactamase-producing Escherichia coli in the sewage of Mexico City: where do they come from? Can J Microbiol. febrero de 2022;68(2):139-45. doi: 10.1139/cjm-2021-0284 PubMed PMID: 34662521.  
  22. Aristizabal-Hoyos AM, Rodríguez EA, Torres-Palma RA, Jiménez JN. Concern levels of beta-lactamase-producing Gram-negative bacilli in hospital wastewater: hotspot of antimicrobial resistance in Latin-America. Diagn Microbiol Infect Dis. enero de 2023;105(1):115819. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2022.115819 PubMed PMID: 36242873.  
  23. Rodríguez EA, Garzón LM, Gómez ID, Jiménez JN. Multidrug resistance and diversity of resistance profiles in carbapenem-resistant Gram-negative bacilli throughout a wastewater treatment plant in Colombia. J Glob Antimicrob Resist. septiembre de 2020;22:358-66. doi: 10.1016/j.jgar.2020.02.033  
  24. Galdamez IA, Jimenez K, Cira M, Osborn K, Ayad M, Lee CM, et al. Evaluating Antibiotic Resistance in Urban Rivers and Coral Reefs of Belize: Evidence for Hotspots and a Potential Screening Tool. GeoHealth. 2026;10(2):e2025GH001427. doi: 10.1029/2025GH001427  
  25. Global action plan on antimicrobial resistance [Internet]. [citado 3 de mayo de 2026]. Disponible en: https://www.who.int/publications/i/item/9789241509763  
  26. de Oliveira Gomes B, Lima W, Vargas D, de Paiva MC. Aminoglycoside resistance in domestic sewage and clinical Escherichia coli isolates [Internet]. 2023 [citado 2 de mayo de 2026]. Disponible en: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-74182022000200625&nrm=iso  
  27. Sierra SDJ, Ilzarbe I, Szpunar J, Moles S, Ruiz-Ripa L, Pérez-Etayo L, et al. Contaminantes emergentes y resistencia antimicrobiana en aguas residuales detección, tratamiento y desafíos desde el enfoque One Health. South Health. 24 de febrero de 2026;3:e002-e002. doi:10.21142/ SH-03-2026-e002  
  28. Hossain H, Ahmed S. Hospital wastewater microbiome & resistome: An overlooked one health crisis driving superbugs in low- and middle-income countries (LMICs). New Microbes New Infect. diciembre de 2025;68:101653. doi: 10.1016/j.nmni.2025.101653  
  29. Vallejos I, Pérez G. Impacto socioeconómico de la resistencia a los antimicrobianos: bajo el enfoque Una Salud en Perú y Latinoamérica. Rev Investig Multidisiplinaria Iberoam. 28 de noviembre de 2025. doi: 10.69850/rimi.vi4.187  
  30. Reichert G, Hilgert S, Fuchs S, Azevedo JCR. Emerging contaminants and antibiotic resistance in the different environmental matrices of Latin America. Environ Pollut. diciembre de 2019;255(Pt 1):113140. doi: 10.1016/j.envpol.2019.113140 PubMed PMID: 31541833.  
↑